Chez l'homme, les anticorps anti-spermatozoïdes se forment suite à une réaction auto-immune dirigée contre l'épithélium spermatogène. Les facteurs étiologiques contribuant au développement d'une telle réaction comprennent les traumatismes testiculaires, les infections bactériennes et virales, les interventions chirurgicales sur le testicule (par exemple, après une vasectomie, des anticorps anti-spermatozoïdes sont détectés chez tous les hommes). Dans certains cas, la cause ne peut être déterminée.