La fièvre hémorragique de Crimée se distingue des autres fièvres hémorragiques, de la grippe, de la leptospirose, de la méningococcémie, de la fièvre typhoïde, des maladies chirurgicales avec le syndrome de « l'abdomen aigu »; ainsi que du purpura thrombocytopénique (maladie de Werlhof) avec un début subaigu caractéristique, une absence de réaction thermique, une éruption hémorragique allant de petites pétéchies à de grandes ecchymoses sur les surfaces fléchissantes des membres, du tronc, des saignements de nez fréquents et d'autres saignements, une anémie hypochrome, une leucocytose, une thrombocytopénie et l'absence de modifications du système cardiovasculaire.