En cas d'exacerbations fréquentes de pyélonéphrite (plus de deux en 6 mois), la prévention de la pyélonéphrite consiste à prescrire des cures prophylactiques mensuelles (1 à 2 semaines) d'agents antibactériens, cependant, des données fiables indiquant l'opportunité de telles cures n'ont pas été obtenues à l'heure actuelle.